ATOL concentre son travail sur les 5 priorités qu’elle a formulées au fil des années :

• empowerment et renforcement des capacités;
• organisation apprenante;
• économie sociale et solidaire;
• genre;
• information pour le développement.

Pour chaque priorité, ATOL accompagne un processus de développement de méthodologies avec des partenaires (par la recherche action), elle offre des contrats de consultance « sur mesure » à la demande d’une organisation et/ou elle met à la disposition de ses partenaires et des intéressé(e)s des documents physiques, numériques et audiovisuels. De cette façon ATOL cherche à atteindre son objectif principal: celui de participer au renforcement des organisations d'appui du Sud afin d'améliorer le fonctionnement et les conditions de vie des organisations de base, telles que les coopératives, les groupements de producteurs, les petits commerçants, les entreprises familiales, etc. ainsi que les individus (à un deuxième niveau).